Le gouvernement du Canada nomme les membres du Conseil des gouverneurs du CRDI. Ces derniers ont de l’expérience en matière de développement international, de technologie, de santé, de sciences naturelles et sociales, de finances et de gestion. Il incombe au Conseil de fournir une orientation stratégique au CRDI, d’en surveiller les activités et d’en approuver le budget. Les membres du Conseil des gouverneurs se réunissent trois fois par année.
En font partie le président du Conseil, le président du Centre et au plus 16 autres gouverneurs. Au moins dix des gouverneurs, dont le président et le vice-président du Conseil, doivent être des citoyens canadiens. Les autres gouverneurs peuvent être des citoyens d’autres pays. Le leadership et les points de vue apportés par les gouverneurs d’autres pays contribuent à ce que les programmes du Centre demeurent pertinents en ce qui a trait aux besoins des pays en développement.